目前，海南洋浦经济开发区作为承接自贸港政策的先行区、示范区，对进出洋浦保税港区的货物，除禁止进出口和限制出口以及需要检验检疫的货物外，已率先试行“一线”放开、“二线”管住的进出境管理制度。
2020年6月3日，海关总署印发《中华人民共和国海关对洋浦保税港区监管办法》，内容包括：
一是在区内试行海南自由贸易港建设总体方案明确的加工增值税收政策。对鼓励类产业企业生产的不含进口料件或者含有进口料件在洋浦保税港区加工增值超过30%的货物，出区进入境内区外销售时免征进口关税，照章征收进口增值税和消费税。
二是简化“一线”申报。在风险可控前提下，洋浦保税港区与境外之间进出的货物除需要口岸检疫检验或必须验核许可证件的货物，包括履行国际公约条约协定，或者涉及安全准入管理的货物以外，企业无需向海关申报，海关径予放行，最大限度地放宽一线进入。
三是突出区内自由，强化区内企业主体责任，实行企业自律管理。一般情况下，区内企业可以依法开展中转集拼、加工制造、交易、研发再制造、检测维修等业务。其经营活动无须办理海关手续，货物在保税港区内不设存储期限。海关取消帐册管理，免于办理海关核销等常规监管手续。同时，海关将充分运用大数据平台，实现风险甄别和智能研判，实施重点的稽核查和查验，实行高效精准的管理。
四是严格“二线”管理。加强围网管理，强化卡口的作用，对保税港区内企业及进出保税港区的车辆（包括行政车辆）、货物、物品、人员，海关依法实施查验监管。
五是改革统计方法。改变海关原有实时逐票统计的方式，将统计数据采集手段前伸至洋浦保税港区管理机构建立的一体化信息管理服务平台，实现自动汇总统计。
六是支持发展国际中转集拼业务。对国家禁止进出境货物外，可在符合海关要求的专用作业场所开展国际中转集拼业务，简化中转集拼货物数据报送方式，实施电子仓单传输。
七是建立协同共管机制。依托洋浦保税港区管理机构建立的一体化信息管理服务平台，搭建统一规范、真实可靠的信息底账库，实现政府部门、口岸监管机构及区内企业之间信息的互联互通、数据可溯、责任可究，建立地方主管、多部门协同监管、企业自管的机制。
八是不禁止区内居住居民及设立营业性的商业设施。考虑到海南自由贸易港涉及商业消费等业态，对洋浦保税港区内设立的营利性商业设施等不做禁止性的规定。
